IC50값 확인과 그래프 간단하게 그리기

IC50 의 정의

IC50값은 생물의 최대 반응의 50%를 억제하는 약물의 농도를 나타냅니다. 특정 생물학적 과정을 억제하는 약물이나 화합물의 효과를 측정하는 데 사용됩니다. 일반적으로 IC50값이 높으면 약물의 효능이 낮다는 것을 나타내고, IC50값이 낮으면 약물 효능이 높다는 것을 의미합니다.

 

IC50값 그래프 그리기

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Graph Pad Prism 사용하는 목적

Graph Pad Prism을 사용하면 즉시 IC50값을 구할 수 있습니다. 이 값은 IC50값, log IC50값 및 R square 값을 나타내며 이는 적합도를 의미합니다. IC50값을 구하고 난 후 그래픽 수정과 분석을 통해 그래프를 간편하고 쉽게 그릴 수 있습니다.

 

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IC50 로그값 그래프 그리는 Protocol

 

그래프 프리즘을 이용하여 IC50 그래프를 그리며 크게 4가지 단계를 거쳐 그래프를 표현합니다.

 

 

• 설정 그래프 형식과 데이터 삽입

 

1. GraphPad Prism를 열고 XY 플롯을 선택합니다.
2. Y축에서 데이터의 N 수만큼 수를 지정하여 생성합니다.
3. 흡광도 등 raw data를 열에 넣어주며, 왼쪽 X값에는 농도를 써넣어 줍니다.

[참고 사항]
그래프 생성 시 x축 값과 y축 값을 지정하는 데이터 시트가 생성되는데, 

 

여러 곡선을 하나의 그래프에 표시할 때 사용되는 다른 열도 있습니다.

단일 곡선을 표시하려면 데이터를 해당 열에만 붙여서 넣으면 됩니다.

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• 농도를 로그값으로 변환

 

1. Analyze 아이콘을 클릭하여 Transform으로 들어가서 X축의 Log[X]를 선택하여 변화시켜 줍니다.                                    (X값의 농도를 로그값 범위로 변환하여 주는 과정)
2. 로그의 10진법은 0의 로그 값이 없으므로 이를 해결하기 위해 농도 테이블에서 X값의 빈 곳에 "1"을 넣어줍니다.

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• 데이터를 정규화로 변환

 

1. 컨트롤 부분의 데이터를 기준점으로 둔 뒤, Analyze - Normalize에서 Percentages로 설정합니다.
2. 이 부분은 Y 값을 퍼센트 스케일로 정규화하여 가장 낮은 값은 0%, 가장 높은 값은 100%로 설정하여 데이터를 분석하는 과정입니다.
3. 데이터 정규화를 통해 낮은 값과 큰 값을 비교하여 백분율로 변환하는 방법을 사용합니다.

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• 그래프 fitting 및 IC50 시각화

 

1. 데이터 정규화 후 생성된 목록 부분을 선택합니다
2.  Analyze - Nonlinear regression (curve fit)을 선택합니다.
3. Dose-response - Inhibition 탭을 선택하고, log vs. normalized response - variable slope 설정
4. 그래프에서 sigmoid curve가 생성되며, R square 값이 1에 가까울수록 fit이 좋다는 의미입니다.
5. 나머지 그래프의 XY 축의 범위는 수정하여 그래프를 조정합니다.

 

 

 

 

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